《合金装备5》原爆点和幻痛的区别是：幻痛游戏画面方面提升了不少，最明显的是光照系统，看起来更加自然柔和。另外因为剧情发售在9年之后，幻痛Big Boss看起来也苍老了许多。
因为《合金装备5：幻痛》是《合金装备5》真正的重头戏，而只有1个多小时内容的《原爆点》只是前戏。
《合金装备5》游戏设定一个在架空的冷战世界，除了对峙中的美国和苏联外，世界的格局还被一种称为"合金装备"(日文:メタルギア;英文:Metal Gear)的武器所影响着。《合金装备V:幻痛》发生在1984年，此时的游戏中和现实一样也在进行着阿富汗战争。尽管游戏大体和现实相同，但是玩家可以发现游戏内的武器和科技要远远比现实中的冷战时期先进。不光是"合金装备"本身，其他军事技术诸如外骨骼、双足机甲、光学隐形、全息影像都被各国谍报机关所使用着。其他科学技术诸如纳米技术、克隆、人工智能也进入了实用化的阶段。
玩家还可以在游戏中发现一些陌生却又熟悉的枪械，例如类似AK74突击步枪的SVG-76突击步枪。而性能相对于现实有些夸张、但却让老玩家怀念的"富尔顿地对空回收系统"也重回作品并在游戏内扮演着举足轻重的角色。
同时，游戏还包含制作人小岛秀夫惯有的幽默气息。比如主角Big Boss可以使用的装备中有被称为"终极隐蔽科技"的道具纸箱子。玩家可以藏在纸箱子里进行移动，并突然钻出纸箱子用消音麻醉手枪击倒敌人。
